A l'inverse du conseil de l'ordre, l'assemblée apocalyptique quand à elle veut s'emparer des Cristaux pour faire régner le mal et détruire l'équilibre qu'ils peuvent apporter. En détruisant les cristaux de lumière, les ténèbres régneront en maître et créeront discorde et apocalypse dans les mondes. C'est le rêve de ses êtres sombres aux noirs desseins. Master Xehanort et Vanitas font partis de ce groupe et d'autres les rejoindront par la suite à la demande du maître.